MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI06

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021498	GA	3	6	9	14	50 %	0 %	50 %	0 %	512595902
2	NC_021498	T	7	7	33	39	0 %	100 %	0 %	0 %	512595902
3	NC_021498	ATC	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595902
4	NC_021498	CT	3	6	152	157	0 %	50 %	0 %	50 %	512595902
5	NC_021498	TAAAA	2	10	190	199	80 %	20 %	0 %	0 %	512595903
6	NC_021498	ATA	2	6	294	299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595903
7	NC_021498	GGAG	2	8	400	407	25 %	0 %	75 %	0 %	512595904
8	NC_021498	CT	3	6	415	420	0 %	50 %	0 %	50 %	512595904
9	NC_021498	CCTC	2	8	430	437	0 %	25 %	0 %	75 %	512595904
10	NC_021498	CTGA	2	8	452	459	25 %	25 %	25 %	25 %	512595904
11	NC_021498	AC	3	6	544	549	50 %	0 %	0 %	50 %	512595904
12	NC_021498	TTAC	2	8	619	626	25 %	50 %	0 %	25 %	512595905
13	NC_021498	GAT	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595905
14	NC_021498	A	6	6	661	666	100 %	0 %	0 %	0 %	512595905
15	NC_021498	ATC	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595905
16	NC_021498	AGT	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595905
17	NC_021498	T	6	6	719	724	0 %	100 %	0 %	0 %	512595905
18	NC_021498	ATT	2	6	728	733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595905
19	NC_021498	A	6	6	900	905	100 %	0 %	0 %	0 %	512595905
20	NC_021498	AGCA	2	8	929	936	50 %	0 %	25 %	25 %	512595905
21	NC_021498	TGAT	2	8	938	945	25 %	50 %	25 %	0 %	512595905
22	NC_021498	CAT	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595905
23	NC_021498	ATT	2	6	1041	1046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595905
24	NC_021498	TCA	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595905
25	NC_021498	AT	3	6	1112	1117	50 %	50 %	0 %	0 %	512595905
26	NC_021498	AAT	2	6	1144	1149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595905
27	NC_021498	TC	3	6	1167	1172	0 %	50 %	0 %	50 %	512595905
28	NC_021498	AT	3	6	1187	1192	50 %	50 %	0 %	0 %	512595905
29	NC_021498	TAA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595905
30	NC_021498	TGTTGG	2	12	1866	1877	0 %	50 %	50 %	0 %	512595906
31	NC_021498	TGG	2	6	1935	1940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595906
32	NC_021498	GAT	2	6	1997	2002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595906
33	NC_021498	TTG	2	6	2039	2044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595906
34	NC_021498	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595906
35	NC_021498	TGT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595906
36	NC_021498	TTCG	2	8	2113	2120	0 %	50 %	25 %	25 %	512595906
37	NC_021498	TTC	2	6	2123	2128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
38	NC_021498	TTC	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
39	NC_021498	AAT	2	6	2150	2155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595906
40	NC_021498	CTT	3	9	2267	2275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
41	NC_021498	GTA	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595906
42	NC_021498	CCGC	2	8	2539	2546	0 %	0 %	25 %	75 %	512595906
43	NC_021498	ATT	2	6	2570	2575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595906
44	NC_021498	CCA	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595906
45	NC_021498	TTA	2	6	2619	2624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595906
46	NC_021498	TTGT	2	8	2720	2727	0 %	75 %	25 %	0 %	512595906
47	NC_021498	CAC	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595906
48	NC_021498	TCG	2	6	2742	2747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595906
49	NC_021498	CTT	2	6	2846	2851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
50	NC_021498	TCGT	2	8	2953	2960	0 %	50 %	25 %	25 %	512595906
51	NC_021498	CTT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595906
52	NC_021498	ACC	2	6	3111	3116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595906
53	NC_021498	ATC	2	6	3138	3143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595906
54	NC_021498	CTCAA	2	10	3177	3186	40 %	20 %	0 %	40 %	512595906
55	NC_021498	TCA	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595906
56	NC_021498	A	6	6	3983	3988	100 %	0 %	0 %	0 %	512595907
57	NC_021498	TGG	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595907
58	NC_021498	CAT	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595907
59	NC_021498	TCA	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
60	NC_021498	TCA	3	9	4190	4198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
61	NC_021498	TCG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595908
62	NC_021498	GAT	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595908
63	NC_021498	CAT	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
64	NC_021498	TTG	2	6	4305	4310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595908
65	NC_021498	AAG	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595908
66	NC_021498	TGA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595908
67	NC_021498	CAT	3	9	4512	4520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
68	NC_021498	CTT	2	6	4522	4527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595908
69	NC_021498	TCA	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
70	NC_021498	CAT	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
71	NC_021498	GTG	2	6	4685	4690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595908
72	NC_021498	TCT	2	6	4718	4723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595908
73	NC_021498	CTA	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
74	NC_021498	TTA	2	6	4940	4945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
75	NC_021498	ATA	2	6	4989	4994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
76	NC_021498	TCA	3	9	5018	5026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
77	NC_021498	ACC	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595908
78	NC_021498	AATT	2	8	5059	5066	50 %	50 %	0 %	0 %	512595908
79	NC_021498	ATA	2	6	5081	5086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
80	NC_021498	TAT	2	6	5106	5111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
81	NC_021498	AAT	2	6	5115	5120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
82	NC_021498	TTA	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
83	NC_021498	TTC	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595908
84	NC_021498	A	6	6	5298	5303	100 %	0 %	0 %	0 %	512595908
85	NC_021498	GTC	2	6	5320	5325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595908
86	NC_021498	ATT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
87	NC_021498	TTG	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595908
88	NC_021498	TTA	2	6	5501	5506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
89	NC_021498	AAT	2	6	5511	5516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
90	NC_021498	GAA	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595908
91	NC_021498	TTA	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595908
92	NC_021498	ACCATT	2	12	5704	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
93	NC_021498	TAA	2	6	5739	5744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595908
94	NC_021498	TAC	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
95	NC_021498	CAA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595908
96	NC_021498	ACT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
97	NC_021498	CAG	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595908
98	NC_021498	TAC	2	6	5991	5996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595908
99	NC_021498	TTG	2	6	6012	6017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595908
100	NC_021498	ACA	2	6	6029	6034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595908
101	NC_021498	TTATGC	2	12	6113	6124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512595908
102	NC_021498	ATTG	2	8	6160	6167	25 %	50 %	25 %	0 %	512595908
103	NC_021498	CTTTAA	2	12	6249	6260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	512595908
104	NC_021498	CAG	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595909
105	NC_021498	TTA	2	6	6319	6324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595909
106	NC_021498	CTA	2	6	6372	6377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595909
107	NC_021498	TA	3	6	6376	6381	50 %	50 %	0 %	0 %	512595909
108	NC_021498	ATA	3	9	6379	6387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595909
109	NC_021498	TAA	2	6	6398	6403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595909
110	NC_021498	CACC	2	8	6415	6422	25 %	0 %	0 %	75 %	512595909

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.